論文

• Minami Imamoto, Haruna Nakamura, Mitsuto Aibara, Ryo Hatashima, Ismael A Kimirei, Benedicto B Kashindye, Takehiko Itoh, Masato Nikaido. Severe Bottleneck Impacted the Genomic Structure of Egg-Eating Cichlids in Lake Victoria, Molecular Biology and Evolution, 41, 6, June 2024.
• Haruna Nakamura, Mitsuto Aibara, Nikaido Masato. Ancient standing genetic variation facilitated the adaptive radiation of Lake Victoria cichlids, Genes & Genetic Systems, 日本遺伝学会, Vol. 98, No. 2, pp. 93-99, Mar. 2023.
• Thomas D. Kocher, Kristen A. Behrens, Matthew A. Conte, Mitsuto Aibara, Hillary Mrosso, Elizabeth C. J. Green, Michael R. Kidd, Masato Nikaido, Stephan Koblmüller. New Sex Chromosomes in Lake Victoria Cichlid Fishes (Cichlidae: Haplochromini), Genes, Vol. 13, No. 5, pp. 804, Apr. 2022.
• Nakamura, H., Aibara, M., Kajitani, R., Mrosso, HDJ, Mzighani, SI, Toyoda, A., Itoh, T., Okada, N., Nikaido, M. Genomic Signatures for Species-Specific Adaptation in Lake Victoria Cichlids Derived from Large-Scale Standing Genetic Variation, Molecular Biology and Evolution, Mar. 2021.  公式リンク  
  
• Nozaki, H., Ryo Matsuzaki, Kashindye, B. B., Ezakiel, C. N., Masanobu Kawachi, Mitsuto Aibara, Masato Nikaido. Morphology, phylogeny, and taxonomy of two species of colonial volvocine green algae from Lake Victoria, Tanzania, PLOS ONE, Vol. 14, No. 11, pp. e0224269, Nov. 2019.
• Takuno Shohei, Ryutaro Miyagi, Jun-ichi Onami, Shiho Takahashi-Kariyazono, Akie Sato, Herbert Tichy, Masato Nikaido, Mitsuto Aibara, Shinji Mizoiri, Hillary D. J. Mrosso, Semvua I. Mzighani, Norihiro Okada, Yohey Terai. Patterns of genomic differentiation between two Lake Victoria cichlid species, Haplochromis pyrrhocephalus and H. sp. 'macula', BMC Evolutionary Biology, Vol. 19, No. 1, pp. 1-68, Mar. 2019.
• Nikaido M, Ota T, Hirata T, Satta, Saito Y, Aibara M, Semvua Mzighani, Kimiko Hagino-Yamagishi, Sturmbauer C, Okada N.. Multiple episodic evolution events in V1R receptor genes of East-African cichlids., Genome Biol. Evol., Vol. 6, 1135-1144, 2014.
• Masato Nikaido, Hideki Noguchi, Atsushi Toyoda, Yutaka Suzuki, Rei Kajitani, Hikoyuu Suzuki, Miki Okuno, Mitsuto Aibara, Benjamin P. Ngatunga, Semvua Mzighani, Hassan W.J. Kalombo, Kawilarang W.A. Masengi, Josef Tuda, Sadao Nogami, Ryuichiro Maeda, Masamitsu Iwata, Yoshitaka Abe, KOJI FUJIMURA, Masataka Okabe, Takanori Amano, Akiteru Maeno, Toshihiko Shiroishi, Sumio Sugano, Yuji Kohara, Asao Fujiyama, NORIHIRO OKADA. Coelacanth genomes reveal signatures for evolutionary transition from water to land, Genome Research, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Vol. 23, No. 10, pp. 1740-1748, Oct. 2013.  公式リンク  
  
• Koichiro Higasa, Masato Nikaido, Taro L. Saito, Jun Yoshimura, Yutaka Suzuki, Hikoyu Suzuki, Hidenori Nishihara, Mitsuto Aibara, Benjamin P. Ngatunga, Hassan W.J. Kalombo, Sumio Sugano, Shinichi Morishita, Norihiro Okada. Extremely slow rate of evolution in the HOX cluster revealed by comparison between Tanzanian and Indonesian coelacanths, Gene, Vol. 505, No. 2, pp. 324-332, June 2012.  公式リンク  
  
• Kohta Yoshida, Yohey Terai, Shinji Mizoiri, Mitsuto Aibara, Hidenori Nishihara, Masakatsu Watanabe, Asato Kuroiwa, Hirohisa Hirai, Yuriko Hirai, Yoichi Matsuda, Norihiro Okada. B Chromosomes Have a Functional Effect on Female Sex Determination in Lake Victoria Cichlid Fishes, PLoS Genetics, Vol. 7, No. 8, pp. e1002203, Aug. 2011.
• Semvua Mzighani, M. Nikaido, M. Takeda, O. Seehausen, Y. L. Budeba, B. P. Ngatunga, E. F. B. Katunzi, Mitsuto Aibara, Shinji MIZOIRI, Tetsu SATO, H. Tachida, NORIHIRO OKADA. Genetic variation and demographic history of the Haplochromis laparogramma group of Lake Victoria-An analysis based on SINEs and mitochondrial DNA, Gene, Vol. 450, pp. 39-47, 2010.  公式リンク  
  

国際会議発表 (査読なし・不明)

• Minami Imamoto, Haruna Nakamura, Mitsuto Aibara, Takehiko Itoh, Masato Nikaido. Did egg-eater lose the ecological competition? Strong population bottleneck in matumbi hunter the paedophage, XXIIIrd International Congress of Genetics, June 2023.
• Haruna Nakamura, Mitsuto Aibara, Hillary Mrosso, Semvua Mzighani, Masato Nikaido. Ancient standing genetic variation facilitated the adaptive radiation of Lake Victoria cichlids, XXIIIrd International Congress of Genetics, June 2023.
• Imamoto, M., Nakamura, H., Aibara, M., Takehiko., Nikaido, M.. Evolutionary history of egg hunting cichlids in Lake Victoria, The 2nd AsiaEvo Conference, Aug. 2021.
• Nakamura, H., Aibara, M., Nikaido, M.. Whole-genome comparative analyses among subpopulations in Lake Victoria cichlid, Haplochromis chilotes, The 2nd AsiaEvo Conference, Aug. 2021.
• Nikaido M, Satta Y, Aibara M, Hagino-Yamagishi K, Okada N.. Multiple episodic evolution events in V1R receptor genes of East-African cichlids, The 10th International Symposium on Molecular and Neural Mechanisms of Taste and Olfactory Perception, Dec. 2012.
• Nikaido M, Sasaki T, Emerson JJ, Aibara M, Mzighani SI, Budeba YL, Ngatunga BP, Iwata M, Abe Y, Li WH, Okada N.. A genetically distinct coelacanth population is discovered off the northern Tanzanian coast., JSPS Asia Africa Science Platform Program, Joint Meeting, Dec. 2011.
• Nikaido M, Hirata T, Satta Y, Saito Y, Aibara M, Mizoiri S, Mzighani SI, Hagino-Yamagishi K, Okada N.. Positive selection and long standing polymorphism on V1R2 in east African cichlids., Workshop on Evolutionary Analyses and Applications “Molecular Evolutionary Studies in Post-Genomic Era, July 2011.
• Nikaido M, Sasaki T, Emerson JJ, Aibara M, Mzighani SI, Budeba YL, Ngatunga BP, Iwata M, Abe Y, Li WH, Okada N.. A genetically distinct coelacanth population is discovered off the northern Tanzanian coast., Annual meeting of SMBE, July 2011.

国内会議発表 (査読なし・不明)

• Nagatoshi Machii, Ryo Hatashima, Mitsuto Aibara, Tatsuki Nagasawa, Masato Nikaido. Comparative Analysis of Hypertrophic Lips in East African Cichlid, 日本進化学会第25回大会, Aug. 2023.
• Minami Imamoto, Haruna Nakamura, Mitsuto Aibara, Masato Nikaido. The Genomic Basis for Trophic Adaptation of East African Egg-Eating Cichlids, 日本進化学会第25回大会, Aug. 2023.
• 賈云帆, 相原光人, 長澤竜樹, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 透明ナマズとその近縁種を用いた発現変動遺伝子解析による筋肉透明化遺伝子の探索, 日本動物学会関東支部会第24回大会, Mar. 2023.
• 今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 卵泥棒・マタンビハンターのボトルネックと進化史, 日本進化学会第27回沼津大会, Aug. 2022.
• 賈云帆, 相原光人, 長澤竜樹, 二階堂雅人. 透明ナマズとその近縁種を用いた系統解析と発現変動遺伝子解析による筋肉透明化遺伝子の探索, 日本動物学会関東支部第74回大会, Mar. 2022.
• 鈴木海理, 相原光人, 二階堂雅人. ヴィクトリア湖産シクリッド嗅上皮の外部形態の種間比較, 日本動物学会関東支部第74回大会, Mar. 2022.
• 今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 卵を食べるシクリッドの系統的起源, 日本動物学会関東支部第74回大会, Mar. 2022.
• 賈云帆, 相原光人, 長澤竜樹, 二階堂雅人. 透明魚とその近縁種を用いたDEG解析による筋肉透明化遺伝子の探索, 第2回日本遺伝学会春の分科会, Mar. 2022.
• 今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 全ゲノムから迫るビクトリア湖産シクリッド Haplochromis sp. “matumbi hunter”の集団史, 日本遺伝学会第93回大会, Sept. 2021.
• 長澤竜樹, 相原光人, 二階堂雅人. 卵保護魚類における卵膜硬化システムの収斂退化, 第6回ユニーク会, Sept. 2021.
• 中村遥奈, 相原光人, 二階堂雅人. ヴィクトリア湖産シクリッド Haplochromis chilotes の集団遺伝解析, 日本遺伝学会第93回大会, Sept. 2021.
• 今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 卵泥棒の起源からシクリッドの適応放散を探る, 日本進化学会第23回東京大会, Aug. 2021.
• 中村遥奈, 相原光人, 二階堂雅人. 東アフリカ産シクリッドにおける VI 型コラーゲンの進化, 日本動物学会関東支部第73回大会, Mar. 2021.
• 今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人. ヴィクトリア湖に生息する卵・稚魚食性シクリッド Haplochromis sp. “matumbi hunter” の進化の歴史, 日本動物学会関東支部第73回大会, Mar. 2021.
• 中村遥奈, 畑島諒, 相原光人, 豊田敦, 伊藤武彦, 二階堂雅人. ヴィクトリア湖産シクリッドHaplochromis chilotesの全ゲノム配列解析による分集団における適応過程の解明, 日本進化学会第22回大会, Sept. 2020.
• 中村遥奈, 相原光人, 豊田敦, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 全ゲノム解析によるヴィクトリア湖産シクリッドにおける種特有の適応パターンの解明, 日本遺伝学会第92回大会, Sept. 2020.
• 今本南, 中村遥奈, 相原光人, 伊藤武彦, 二階堂雅人. ヴィクトリア湖固有シクリッド Haplochromis sp. “matumbi hunter” の遺伝的多様性, 日本進化学会第22回大会, Sept. 2020.
• 中村遥奈, 相原光人, 豊田敦, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 全ゲノム配列解析による異なる湖底環境に生息するヴィクトリア湖産シクリッド3種の適応過程の解明, 日本動物学会関東支部第72回大会, Mar. 2020.
• 中村遥奈, 相原光人, 豊田敦, 伊藤武彦, 二階堂雅人. 全ゲノム配列解析による異なる湖底環境に生息するヴィクトリア湖産シクリッド3種の適応過程の解明, 第2回日本遺伝学会春季分科会, Mar. 2020.
• 長澤竜樹, 相原光人, 川口眞理, 二階堂雅人. カワスズメ科魚類における孵化腺細胞の局在の進化, 日本動物学会関東支部第72回大会, Mar. 2020.
• Hisayoshi Nozaki, Ryo Matsuzaki, Benedicto Boniphace Kashindye, Charles Nyarongo Ezekiel, Masanobu Kawachi, Mitsuto Aibara, Masato Nikaido. "Colonial volvocines from Lake Victoria, Tanzania", Volvox 2019, July 2019.
• 野崎久義, 松崎令, Benedicto B. Kashindye, Charles N. Ezekiel, 河地正伸, 相原光人, 二階堂雅人. ボルボックスの仲間を求めてアフリカの古代湖へ, 日本植物分類学会第18回大会, Mar. 2019.
• 中村遥奈, 畑島諒, 相原光人, 二階堂雅人. 全ゲノム配列解析によるヴィクトリア湖産シクリッド3種の適応機構の解明, 第１回遺伝学会分科会, Mar. 2019.
• 野崎久義, 松崎令, Benedicto B. Kashindye, Charles N. Ezekiel, 河地正伸, 相原光人, 二階堂雅人. タンザニア・ヴィクトリア湖産群体性ボルボックス目, 日本藻類学会第43回大会, Mar. 2019.
• 二階堂雅人, 颯田葉子, 相原光人, 菊池潔, 山岸公子, 岡田典弘. シクリッドV1R遺伝子の多様化と性決定領域との関連性, 第15回日本進化学会, Aug. 2013.
• 二階堂雅人, 颯田葉子, 相原光人, 山岸公子, 岡田典弘. シクリッドV1R受容体遺伝子群に繰り返し働いた正の選択, 第14回日本進化学会, Aug. 2012.
• 和田亮一, 坂井三郎, 二階堂雅人, 相原光人, 大河内直彦, 岡田典弘, 山田桂太, 吉田尚弘. 耳石の同位体分析によるシーラカンスの生息水深推定, 2010年度日本地球化学会第57回年会, 2010年度日本地球化学会第57回年会講演要旨集, 日本地球化学会, p. 125, Sept. 2010.
• 二階堂雅人, 平田直, 斉藤曜平, 相原光人, 溝入真治, Semvua I. Mzighani, 山岸公子, 岡田典弘. シクリッド集団中における長期間の多型維持とその後の分断選択, 第12回日本進化学会, Aug. 2010.
• 二階堂雅人, 平田直, 相原光人, 溝入真治, 山岸公子, 岡田典弘. シクリッド嗅覚受容体V1R2遺伝子において観察された大規模な種間多型, 第１０回日本進化学会, Aug. 2008.
• Mzighani SI, Nikaido M, Takeda M, Aibara M, Mizoiri S, Tachida H, Okada N.. Population genetics of Lake Victoria slender body HaplochromineCichlids., 第１０回日本進化学会, Aug. 2008.

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