論文

• Kosuke Kikuchi, Koki Date, Takafumi Ueno. Design of a Hierarchical Assembly at a Solid–Liquid Interface Using an Asymmetric Protein Needle, LANGMUIR, Vol. 39, Issue 6, Page 2389–2397, Feb. 2023.
• Kosuke Kikuchi, Tatsuya Fukukyama, Takayuki Uchihashi, Tadaomi Furuta, Yusuke Maeda, Takafumi Ueno. Protein needles designed to self-assemble through needle tip engineering, Small, vol. 18, no. 10, pp. 2106401, Jan. 2022.  公式リンク  
  
• Que D. Nguyen, Kosuke Kikuchi, Mariko Kojima, Takafumi Ueno. Dynamic Behavior of Cargo Proteins Regulated by Linker Peptides on a Protein Needle Scaffold, Chemistry Letters, Oct. 2021.  公式リンク  
  
• Dan Que Nguyen, Kosuke kikuchi, Basudev maity, Takafumi Ueno. The versatile manipulations of self-assembled proteins in vaccine design, International Journal of Molecular Sciences, Feb. 2021.
• Takafumi Ueno, Kento Niwase, Daisho Tsubokawa, Kosuke Kikuchi, Natsumi Takai, Tadaomi Furuta, Ryuji Kawano, Takayuki Uchihashi. Dynamic behavior of an artificial protein needle contacting a membrane observed by high-speed atomic force microscopy, Nanoscale, vol. 12, no. 15, pp. 8166-8173, Apr. 2020.

国際会議発表 (査読なし・不明)

• Kosuke Kikuchi, Chi Long Chan, Tiezheng Pan, James W. Hindley, Satoshi Abe, Oscar Ces, Takafumi Ueno. Multi-compartment hydrogels harboring functional protein crystal reactors, 3rd International Symposium on Biofunctional Chemistry, Apr. 2024.
• Kosuke Kikuchi, Kento Niwase, Takafumi Ueno. Assembly Formation of Needle-Like Protein from Bacteriophage T4 Observed by High Speed Atomic Force Microscopy, 10th International Conference on Materials for Advanced Technologies, June 2019.  公式リンク  
  

国内会議発表 (査読なし・不明)

• 菊池幸祐, 上野隆史. 多段階酵素反応実現に向けた細胞内タンパク質結晶の構築, 第73回高分子討論会, Sept. 2024.
• 菊池幸祐, 永間美咲, Haonan Kong, 田中潤子, 安部聡, 上野隆史. 細胞内タンパク質結晶の分子設計による結晶格子変形, 第18回バイオ関連化学シンポジウム, Sept. 2024.
• 菊池幸祐, Chi L. Chan, Tiezheng Pan, James W. Hindley, 安部聡, Oscar Ces, 上野隆史. 細胞内タンパク質結晶―ゲル複合化による機能性小胞の構築, 第34回バイオ・高分子シンポジウム, Aug. 2024.
• Xin Li, Thuc Toan Pham, Kosuke Kikuchi, Koki Date, Souta Masumura, Takafumi Ueno. Structure and dynamics of pH-responsive ribbon-like protein analyzed by atomic force microscopy, 104th CSJ Annual Meeting, Mar. 2024.
• 鱒村 颯太, 伊達 弘貴, Thuc Toan PHAM, Xin Li, 菊池 幸祐, 上野 隆史. pH 応答性伸縮タンパク質集合体の階層構造解析, 日本化学会 第104春季年会, Mar. 2024.
• Date Koki, Kikuchi Kosuke, Masumura Souta, Xin Li, Thuc Toan PHAM, UCHIHASHI Takayuki, KAMIKUBO Hironari, MURATA Kazuyoshi, UENO Takafumi. Shape morphing mechanism of pH-responsive piston protein, The 61st Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Nov. 2023.
• 菊池 幸祐, 伊達 弘貴, PHAM Toan Thuc, 上野 隆史. 動的伸縮タンパク質分子リボンR-bodyの組成解明, 第72回高分子討論会, Sept. 2023.
• 菊池 幸祐, Bruno Frka-Petesic, Silvia Vignolini, 上野 隆史. タンパク質複合化によるセルロースナノ結晶構造色フィルムの物性制御, 第33回バイオ・高分子シンポジウム, July 2023.
• Kosuke Kikuchi, Bruno Frka-Petesic, Silvia Vignolini, Takafumi Ueno. Developing protein-cellulose nanocrystal hybrid films for structural coloration, 103rd CSJAnnual Meeting, Mar. 2023.
• 伊達弘貴, Thuc Toan Pham, Hyeonho Lee, 菊池幸祐, 上野隆史. pH応答性伸縮タンパク質集合体の細胞内形成メカニズム, 第12回CSJ化学フェスタ2022, Oct. 2022.
• Kosuke Kikuchi, Koki Date, Takafumi Ueno. Head-to-head and Tail-to-tail Dual Interactions by Head-tail Asymmetric Protein Needles for Designing Hierarchical Two-dimensional Assembly Networks Head-tail, 71st Symposium on Macromolecules, Sept. 2022.
• Kosuke Kikuchi, Takafumi Ueno. Design of the heteroepitaxial vertical assembly of asymmetric protein needles, 日本化学会第102春季年会, Mar. 2022.  公式リンク  
  
• 菊池 幸祐, 福山達也, 古田 忠臣, 内橋 貴之, 前多裕介, 上野 隆史. βヘリックスタンパク質分子針の末端設計による二次元集合制御, 第15回バイオ関連化学シンポジウム, Sept. 2021.
• 菊池 幸祐, 福山達也, 古田 忠臣, 前多裕介, 内橋 貴之, 上野 隆史. タンパク質分子針の末端構造設計による二次元集合パターン制御, 第70回高分子討論会, Sept. 2021.  公式リンク  
  
• 菊池 幸祐, Tatsuya Fukuyama, 古田 忠臣, Yusuke T. Maeda, 内橋 貴之, 上野 隆史. タンパク質分子針の末端デザインによる二次元集合パターン構築, 生体機能関連化学部会 若手の会 第32回 サマースクール, July 2021.
• 菊池幸祐, 福山達也, 古田忠臣, 前多裕介, 内橋貴之, 上野隆史. タンパク質分子針の末端設計による二次元集合パターン制御, 第１回発動分子科学研究会, June 2021.
• 菊池幸祐, 福山達也, Maity Basudev, 古田忠臣, 前多裕介, Takayuki Uchihashi, 上野隆史. β-ヘリックス人工分子針の動的集合設計, 日本化学会第101春季年会, Mar. 2021.
• Kosuke Kikuchi, Takafumi Ueno. Design of the two-dimensional protein assembly patterns by β-helical protein needle, 第69回高分子討論会, Sept. 2020.
• Kosuke Kikuchi, Takafumi Ueno. Design of the Two-dimensional Protein Assembly Patterns by Modifying the Tip of β-helical Protein Needle, The 100th CSJ Annual Meeting, Mar. 2020.
• 菊池幸祐, 上野隆史. 高速原子間力顕微鏡による針状タンパク質の集合体構造の解析, 第9回CSJ化学フェスタ2019, Oct. 2019.  公式リンク  
  
• 菊池幸祐, 上野隆史. 高速原子間力顕微鏡による針状タンパク質の集合体観察, 第68回高分子討論会, Sept. 2019.  公式リンク  
  
• 菊池幸祐, 庭瀬建人, 上野隆史. 高速原子間力顕微鏡によるT4ファージ由来分子針の集合化追跡, 日本化学会第99春季年会, Mar. 2019.  公式リンク  
  

学位論文

• Dynamics-coupled Design of Protein Needles for Constructing Self-assembly Structures,  Outline,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2024/03/26,   
• Dynamics-coupled Design of Protein Needles for Constructing Self-assembly Structures,  Exam Summary,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2024/03/26,   
• Dynamics-coupled Design of Protein Needles for Constructing Self-assembly Structures,  Summary,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2024/03/26,   
• Dynamics-coupled Design of Protein Needles for Constructing Self-assembly Structures,  Thesis,  Doctor (Science),  Tokyo Institute of Technology,  2024/03/26, 

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